Digimon Survive vê um novo grupo de adolescentes, liderado por Takuma Momozuka, perder-se numa viagem de campismo escolar, encontrando-os transportados para um estranho mundo novo de monstros e perigo.
À medida que lutam pelo seu regresso a casa através de um mundo animado de decisões difíceis e batalhas mortais, as escolhas dos jogadores ao longo do jogo terão impacto na evolução dos seus aliados monstros e no final.